1955年1月《中医杂志》创刊。《中医杂志》的前身为《北京中医》，1955年更名为《中医杂志》，这是第一家面向全国发行的中医药学术期刊。编委会成员包括当时中医学界知名人士。

    　《中医杂志》为月刊，16开72面。1960年下半年至1961年上半年曾停刊11期。1966年8月“文化大革命”开始后停刊。

    　1972年5月，《中医杂志》经国务院批准复刊，并更名为《新医药学杂志》。1972年为季刊，出版2期，1973年起改为月刊。1979年7月，恢复《中医杂志》刊名。

    　1985年中医杂志创刊30周年之际，在北京举行了纪念活动，全国人大常委会委员长彭真为《中医杂志》题词：“希望医务界继续全面地系统地集中、整理我国各族人民长期同疾病斗争、保护健康的经验和传统医药学，并大力提高发展和推广它”。卫生部部长、中华全国中医学会会长崔月犁。中国科协副主席裴丽生，卫生部副部长胡熙明及在京编委、著名专家教授到会祝贺。

    　1995年1月《中医杂志》创刊40周年之际，全国人大常委会委员长乔石为《中医杂志》题词：“继续开发祖国传统医学宝库，造福人民健康。”国家副主席荣毅仁题词：“办好中医杂志，发扬祖国医学”。全国人大常委会副委员长吴阶平题词：“传播中医，弘扬国粹”。国务委员彭珮云题词：“办好中医杂志，宏扬祖国医学”。全国政协副主席杨汝岱题词：“办好中医杂志，发展特色中医药事业”。卫生部长陈敏章、副部长胡熙明、原部长钱信忠等领导同志也题词祝贺。在北京钓鱼台国宾馆举行的纪念会上，全国政协副主席杨汝岱等领导同志前往祝贺。

    　2005年4月23日，在北京人民大会堂举行《中医杂志》创刊50周年纪念会暨全国中医药发展论坛。国务院总理温家宝为《中医杂志》创刊50周年题词：“实行中西医结合，发展传统医药学”。全国人大常委会副委员长许嘉璐题词：“儒道岐黄一脉承，协调主客务平衡，川溪俱纳求新术，去伪存真此路恒”。全国政协副主席李蒙题词：“宣传理论与实践成果，做发展中医药的先锋”。全国人大常委会原副委员长吴阶平出席会议题词：“办好中医杂志，弘扬祖国医学”。全国政协副主席李蒙，国家新闻出版总署副署长邬书林，中纪委驻卫生部纪检组组长张凤楼，国家中医药管理局副局长吴刚、于文明出席会议。卫生部原部长钱信忠等领导同志也题词祝贺。

    　1992年《中医杂志》获中国科协优秀学术期刊一等奖；获国家科委、中宣部、国家新闻出版署首届全国优秀科技期刊三等奖。1995年～1999年《中医杂志》获首届、第二届中医药优秀期刊一等奖。2000年获我国期刊出版最高奖——首届国家期刊奖。连续七年荣获中国科协自然科学基础性、高科技学术期刊经费资助奖。

    　中医杂志社于1981年创办了《中医杂志》英文版（季刊）成为当时唯一用外文出版的中医药学术期刊。此后，又相继与国外学术团体合作创办了日文、德文、西班牙文、意大利文、韩文、比利时文、葡萄牙文、荷兰文及法文版，向世界各地发行。

    　自1994年起，中医杂志社每年都召开一至二次全国性的学术会议，国家中医药管理局李振吉、房书亭、吴刚等领导同志多次出席。