古代

　　昌平历史悠久，雪山文化遗址出土的文物证实，早在六千多年前就有人类在这里生产、繁衍生息。因居庸关在区城西北，自秦汉以来即为交通要冲。西汉始置昌平县，与军都县并存。

　　唐初，治所迁至白浮图城(今旧县村)。武德元年(618年)属幽州，天宝元年(742年)属范阳郡，乾元元年(758年)属幽州。开元二十五年(737年)至建中二年(781年)，燕州及所领之辽西县侨置于桃谷山(今桃峪口一带)。神龙年间(705年一707年)，带州及所领之孤竹县侨置于清水店(今太舟坞，现属海淀区)。

　　五代后唐同光二年(924年)改称燕平，迁治所于曹村(今朝凤庵)，同光三年(925年)，治所迁回白浮图城。后晋天福元年(936年)，复称昌平县。天福二年(937年)，石敬塘将幽蓟十六州割让给契丹，昌平遂属辽地。初属幽都府，开泰元年(1012年)，改幽都府为析津府，遂属析津府。

　　宋宣和四年(1122年)至七年(1125年十二月,属燕山府。金天会三年(1125年)改燕山府为析津府，贞元元年(1153年)改称大兴府；昌平初属析津府，后属大兴府。

　　元属大都路。皇庆二年(1313年)，治所迁至辛店(今辛店村)；至正年间(1341年至1368年)，治所迁回白浮图城。

　　明初属北平府。永乐元年(1403年)属顺天府，景泰三年（1452年）治所迁至永安城(即今址)。正德元年(1506年)升为州，辖密云、顺义、怀柔三线。正德三年（1508年）降为县，辖县改属顺天府。正德九年（1514年）复升为州，辖县如旧。清属顺天府。雍正五年（1727年），辖县改属顺天府。

　　近代

　 民国时期，1913年改称昌平县，属顺天府o 1914年属京兆方。1928年属河北省o1935年12月25日属伪冀东防共自治政府。1937年属河北省冀东道。1943年7月属河北省燕京道。

1939年3月至1948年共产党在与邻县交界处建立民主政权，与侵华日军、国民党政权进行斗争。1948年12月12日，昌平解放。

1949年4月称昌平县，属察哈尔省南口专署。1949年8月属河北省通县专署。

　　现代

1956年3月9日划归北京市，称昌平区。1960年1月7日复称昌平县，1999年9月16日，昌平撤县设区。

　　2002年，昌平区下设17个镇、办事处，即：城北街道办事处、昌平镇、南口镇、沙河镇、南邵镇、马池口镇、崔村镇、兴寿镇、小汤山镇、北七家镇、百善镇、东小口镇、回龙观镇、阳坊镇、流村镇、长陵镇、十三陵镇等。下辖309个行政村、71个社区居委会。