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2009年5月25日，国务院办公厅发布《国务院批转发展改革委关于2009年深化经济体制改革工作意见的通知》，转发给各省、自治区、直辖市人民政府，国务院各部委、各直属机构，要求各地认真贯彻执行。
发改委《关于2009年深化经济体制改革工作意见》（以下简称意见）指出，今年是进入新世纪以来我国经济社会发展最为困难的一年。国际金融危机尚未见底，经济增速明显放缓，长期积累的体制机制矛盾更加突出。复杂严峻的国际国内经济形势要求我们毫不动摇地继续深化改革开放。
意见涉及垄断行业改革、民间投资、产业结构优化、所有制结构调整、农村经济、金融改革等方面，并指定了各项改革的牵头部门，其主要内容如下——
垄断行业：拓宽民间投资的领域和渠道
加快研究鼓励民间资本进入石油、铁路、电力、电信、市政公用设施等重要领域的相关政策，带动社会投资。
抓紧研究制订铁路体制改革方案，加快推进铁路投融资体制改革。继续深化电信体制改革，制定出台配套监管政策，加快形成有效的市场竞争格局；深化邮政体制改革，推动邮政速递物流业务重组改制。
落实国家相关规定，实现广电和电信企业的双向进入，推动“三网融合”取得实质性进展。
加快推进电网企业主辅分离和农电体制改革。制订出台盐业管理体制改革方案。
加快推进市政公用事业改革，扩大城市供水供热供气、污水处理、垃圾处理等特许经营范围。
能源：推进资源性产品价格和节能环保体制改革
继续深化电价改革，建立与发电环节适度竞争相适应的上网电价形成机制；推进输配电价改革；调整销售电价分类结构，减少各类用户电价间交叉补贴；适时理顺煤电价格关系；研究制订农村电力普遍服务政策。
完善煤炭成本构成，反映开采、经营过程中的资源、环境和安全成本。
完善天然气价格形成机制，逐步理顺与可替代能源的比价关系。加快建立初始水权制度；积极推进水价改革，逐步提高水利工程供非农业用水价格，完善水资源费征收管理体制。
完善节能减排目标责任评价考核体系和多元化节能环保投入机制；健全高效节能环保产品推广激励制度及落后产能退出机制；研究建立循环经济考核体系。
探索建立环境法制、绿色信贷、政绩考核、公众参与等环境保护长效机制。
加快推进污水处理、垃圾处理等收费制度改革。加快推进跨省流域生态补偿机制试点工作；扩大排污权交易试点范围，完善相关法律法规。
建立资源型城市可持续发展准备金制度；推进矿产资源补偿费制度改革，建立与资源利用水平和环境治理挂钩的浮动费率机制。
产业结构：鼓励社会力量兴办民办非企业单位
继续推进国有企业公司制股份制改革，健全公司治理结构，完善现代企业制度；继续推进国有资本结构优化和战略性调整；完善国有资产监督管理体制和制度 。
完善鼓励支持和引导个体私营等非公有制经济发展的政策措施。
抓紧完善中小企业贷款担保基金和贷款担保机构等多层次担保体系，建立健全中小企业信用担保风险补偿机制；推进中小企业信用制度和信用担保机构评级制度建设。
继续发展中小企业板市场，稳步发展中小企业集合债券，继续开展中小企业短期融资券试点。
完善服务业发展规划体系，加快建立促进现代服务业发展的体制机制和政策体系，推动服务业发展和产业结构优化。
进一步放宽服务业市场准入，鼓励非公有制企业参与国有服务企业改革。
深化政府机关和事业单位后勤服务社会化改革。
鼓励社会力量兴办民办非企业单位，培育多元化的服务业市场主体。
民生：提高居民消费能力和意愿
加强公共就业服务体系建设，加大政策支持力度，建立灵活多样的就业和创业促进机制，进一步完善以创业带动就业的政策措施。
研究出台关于收入分配调节的指导意见。
规范国有企业负责人薪酬管理制度，合理控制收入分配差距。
研究制订事业单位实施绩效工资的意见。
推动工资集体协商和工资支付保障制度建设，落实最低工资制度；完善基本养老保险制度，继续开展做实个人账户试点，全面推进省级统筹；出台养老保险关系转移接续办法；推进事业单位养老保险改革试点；制订实施农民工养老保险办法； 出台新型农村社会养老保险指导意见；研究解决农垦职工社会保障问题。
建立企业退休人员基本养老金和城乡最低生活保障标准正常调整机制。
健全廉租住房制度，规范经济适用住房建设与管理，建立健全保障性住房规划建设管理体制。
推动林区棚户区房屋产权制度改革试点。
健全食品药品安全监管体制，实行严格的食品质量安全追溯、召回、市场准入和退出制度。
农村：推进农民专业合作组织发展
深化农村综合改革，着力增强乡镇政府社会管理和公共服务职能。
推进农村集体建设用地管理制度改革，研究制订流转管理办法，探索建立统一规范的城乡建设用地市场；深入推进土地有偿使用制度改革，严格限定划拨用地范围。
开展农村土地承包经营权登记试 点，建立健全土地承包经营权流转市场，加强流转管理和服务，发展适度规模经营；推进国有农场体制改革。
加快推进集体林权制度改革，完善相关 配套政策；积极推进国有林区、国有林场体制改革。
完善粮食等主要农产品[17.50 4.17%]价格形成机制；深化国有粮食企业改革。
完善与化肥、柴油等农资价格挂钩的农资综合补贴动态调整机制。
加快推进基层农技推广体系改革，构建新型农业社会化服务体系，推进农业产业化和农民专业合作组织发展。
探索建立城乡规划建设一体化管理体制。
探索建立统筹城乡的就业和社会保障政策体系。
研究制订放宽中小城市落户条件、允许符合条件的农村居民在城市落户的相关政策；推动流动人口服务和管理体制创新。
财税：研究开征物业税
围绕推进基本公共服务均等化和主体功能区建设，健全中央政府和地方政府财力与事权相匹配的体制；推进省直管县财政管理方式改革，逐步建立县级基本财力保障机制；提高一般性转移支付的规模和比例，加快完善统一规范透明的财政转移支付制度；健全公共财政职能，优化财政支出结构。
深化预算制度改革，研究起草国有资本经营预算条例，试行社会保险预算制度，实现政府公共预算、国有资本经营预算、政府性基金预算和社会保障预算有机衔接）。
研究建立全国行政事业单位国有资产统计报告制度。
全面实施增值税转型改革；统一内外资企业和个人城建税、教育费附加等税收制度；研究推进综合和分类相结合的个人所得税制度；研究制订并择机出台资源税改革方案；加快理顺环境税费制度，研究开征环境税；深化房地产税制改革，研究开征物业税。
金融：出台放贷人条例
深化国有控股商业银行改革；继续推进政策性银行改革。
推进金融资产管理公司改革。
稳步发展各种所有制中小金融企业和新型农村金融机构；推进农村信贷担保机构发展。
扩大农村有效担保范围，发展农村多种形式担保的信贷产品。
出台放贷人条例，积极引导民间融资健康发展。
建立健全存款保险制度。推进利率市场化改革，完善人民币汇率形成机制 。
加强资本市场基础性制度建设，建立健全有利于资本市场稳定发展和投资者权益保护的法规体系；适时推出创业板，推进场外市场建设，完善资本市场功能。
完善债券市场化发行机制、市场约束与风险分担机制，逐步建立集中统一的债券市场监管规则和标准。
深化保险业改革，积极发挥保险保障和融资功能。加快股权投资基金制度建设，尽快出台股权投资基金管理办法。
建立健全金融监管协调机制和国际合作机制。
意见最后指出，各部门要结合自身职能，积极支持和指导改革试点，将有关专项改革试点放在相应试验区先行先试。各地区可结合自身实际，在有效防控风险的前提下，积极开展各类综合和专项改革试点。
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