3000多名国民党士兵被迫跳进甸安河中，在追击日军的机枪弹幕射击下，几乎无一生还。日军随后对各村进行大搜捕，抓到的人不分男女老幼全部用绳子串起来，集中到甸安河边的几个禾场上屠杀。
甸安河边的田里土里、房前屋后、河中岸边，到处是尸体。昔日清澈的甸安河几成血河。一场暴雨过后，岸上的尸体也被冲入河中，北风一吹，又集到甸安河南端，塞满了一里多长的河道。尸体腐烂后，臭气熏天，几里之外可闻。从此，当地人称甸安河为“血水河”——“甸安河，甸安河，尸体挤得个挨个；五里长河成血海，野狗无桥可通过。”
5月10日，天刚蒙蒙亮，日军从东西两个方向向横贯厂窖大垸的瓦连堤扑来。7里长的瓦连堤上住着几百户农家，此时还有数千外地难民。
杨凤山屋场的巷口，60多个逃难同胞被日军堵在了这里。30多个男人绑成一串，赶进深水塘中全部淹死，20多个妇女被驱赶入一所民房，轮奸后被日军放火活活烧死。瓦连堤西端的风车拐，方圆不足半公里，被杀同胞700多人。幸存者王长生回忆说：“挨近风车拐南边的莲子湖，300多名同胞全被赶进湖里活活淹死。风车拐的堤面、堤坡上被杀的有200多人。汤二秀屋台上也被杀了100多人。风车拐共28户人家，被杀绝的就有13户。”
据幸存者刘银生回忆：农民陈腊九被日军抓到后，被绑在树上拷打，最后开膛破肚；农民汪宏奎，年过60，耳聋，鬼子见其问话不答，便用刀将他的舌头与下颚割掉，使其巨痛几天后死去；一个周姓农民，被日军剁了好几刀，通身抹上盐，再用坛子在其身上乱滚，皮开肉绽惨死；两个难民被日军绑在树上，用刺刀剖开肚子，取出胆囊，再用小瓶汲取胆汁“珍藏”。农民贾运生被日军抓住后，因想逃跑，日军竟用刺刀捅进贾的耳朵，来回剜戳，至死方休。
肖家湾村村民吴桂清回忆说道：“当时我才10岁，我亲眼看见一位20来岁的姑娘拼命反抗，就被鬼子倒插在水沟烂泥中，然后掰开双腿，举起东洋刀从中劈成两块！一个15岁的少女在自家屋后竹坡里被4个鬼子轮奸，全身被捅14刀。”
整个厂窖地区被日军强奸的妇女多达2500多人，仅瓦连堤上就有67名。事后统计，瓦连堤一带遇害同胞共3000多人，其中73户被杀绝，330多间房屋化为了灰烬。
当陆路上的日军在厂窖垸里疯狂烧杀的时候，水路上的日军也在厂窖河中干着同样的勾当。三天之内，日军在北起太白洲，南至龚家港的厂窖东西两侧河段中，屠戮船民、难民6800多人，烧毁船只2500余艘。
三面临水的厂窖大垸，水上交通发达。东北、西南两侧则有藕池河中支、淞澧洪道环流而过，另还有一条长约2公里、宽约400米的龚家港河横卧于垸内的东南地区。大批逃难的船只云集在此，通过厂窖大岛两侧大河向常德、益阳等安全河港逃亡，但很快被日军汽艇包围。
5月9日清晨起，日军沿河炸船、烧船。先是飞机轰炸，继而武装汽艇沿河来回追捕，逼着大大小小的船只在沿岸一线停靠下来。他们先是上船搜索，掳掠财物，继而放火烧船。只见河中火光冲天，大火昼夜不熄。船民、难民哀嚎之声不绝于耳，数里可闻。
在汀浃洲一带，日军汽艇堵住湖口子后，将船上的船民、难民赶到附近河洲上，把人们三、五十人为一群，用绳索连串捆绑起来，再将绳子首端拴在汽艇后面，开足马力，把这一串串的人拖入河中淹死。在玉成堤上的河洲上，日军将捉住的30多个船民，用一根10来米长的纤绳，套住船民颈项，然后将在场的日军分成两队，各握纤绳一端，像“拔河赛”一样，不一会，这些船民便被勒死了……
三天杀三万，日本华中方面军第11军算是创下了一个纪录，一个挑战人类暴力极限的纪录。
一个月以后，国民党《阵中日报》的记者袁琴心来到厂窖，她看到的是“两岸烧焦的船，像晒鱼一般的摊摆着。”“厂窖河里的死尸，简直使船只不能通过。只要船身往河里一动，前后左右都翻出死尸来，腐烂的肉浆，会将船身四周粘着。草草掩埋的尸体，数十人或百余人共墓一穴，到处都有。现在经过，犹闻臭气，骸骨且有被雨水冲露在外面的，真是悲惨啊！”
6月6日，《阵中日报》刊发了报道：“此次厂窖、鸡窝岭、丁家洲、肖家湾一带，被惨杀军民同胞，为数上，万，，该地同胞均已全部杀光，无幸存者，河水为之变色，迄今死尸仍未全部掩埋，当日河内之浮尸，有如厕内之蛆虫，无从估计数目。此即中古时代所作之‘血洗’，今日亲见于厂窖丁家洲者。”
