明神宗朱翊钧的石景山情结源于永定河的水患。

　　万历十五年（1587年），永定河（时名浑河）发大水，淹了北京城，大水40多天才退。神宗由此得知发水原因是浑河上游石景山段决口，就记住了山名，想找机会到石景山看看。第二年秋天，浑河决口处大堤合龙，神宗要亲自主持合龙仪式，便在众多大臣的陪伴下，登上石景山观望浑河水势。

　　石景山形状独特，东南坡舒缓，满目苍翠；西北崖陡峭，怪石嶙峋。明许用宾在《重建石景山天主宫碑记》中说，“神京之西，四十里许，山曰石经，又云湿（应为tà音，至明代误读为shī音）经，亦名石景。惟山雄峙一方，高接云汉，钟灵秀之气，郁造物之英，真为燕都第一仙山也”。从此，石景山便有燕都第一仙山之谓。

　　那年神宗正值青春年华，由南天门径直登上金阁寺塔，转身西望，只见一条黄色巨河游龙般从西山奔涌而出，掀着巨浪向南飞流而去，撞击着石景山，有种地动山摇的感觉。神宗初识浑河真面目，方知治理此河不可懈怠。

　　下山主持大堤合龙仪式后，神宗沿河巡视，信步来到浑河的板桥边，迈步踏上晃晃悠悠的板桥，在太监的帮扶下，一步一摇地走到河心。只见脚下浑黄的滔滔河水翻滚激荡，浊浪像扑面而来，又奔腾而去，让人心惊肉跳，便马上问起这条河的来龙去脉。首辅大臣申时行告诉他：“这条河的源头在高原大漠，过居庸关时已经汇集了几十条河的水量，从石景山流向天津，注入渤海。我们现在站的地方比前门楼子还要高，这里一决口子，整个京城就要被淹”。神宗不禁感叹道：“看见这条河，那黄河的可怕，闭着眼也能想象出来了！”他吩咐申时行：“我总听说黄河水势如何如何，我还有点儿不信，现在看见浑河这么可怕，就知道治理黄河有多难了。你一定要帮我选用得力的人管好治河，让工部的官员务必小心谨慎，抓紧加固堤岸。”

　　神宗触景生情，到行宫吃罢饭后，命令大臣们奉献诗文，记载他巡河之事。众大臣自然不敢怠慢，立刻抖擞精神，各显神通，利用绝佳机会拍起神宗的马屁来。这个说，浑河“惊涛喷薄三千尺”，皇帝到此“河出图，洛出书”，跟汉武帝视察黄河一样，为的是“坐令陆海俱安澜”，使江山万年巩固；那个讲，皇帝驾临石景山，是“皇情一日遍九州”，不是游山玩水，而是体恤百姓，大臣们“恭承宣诏非敢后，驽马不及随飞龙”，是欣逢盛世；还有的说皇帝视察的场面是“万岁呼声起山下”，“君臣鱼水同徘徊”，“翠华行处天颜喜”……不一而足。神宗好大喜功，自然听得惬意，高兴得合不拢嘴。

　　明神宗巡石景山、临浑河水距今已有四百多年，石景山上留有他的亲笔手书“灵根古柏”石刻，至今保存完好。