南通市交通局是市政府主管全市公路、水路等交通行业的职能部门，主要负责对全市公路、水路客货运输、出租车客运、旅游运输、联合运输等运输服务业的行业管理；负责交通基础设施建设的规划、建设、养护和管理，会同有关部门负责全市交通建设市场管理；负责重点交通工程建设的实施；负责公路标志、标线和航标及交通监控、通讯等附属设施的设置、管理；检查监督交通建设工程质量；负责全市交通系统安全生产的监督管理；负责全市内河水上交通安全管理、港航监督、船舶（含船用产品、水上设施）检验和船员证照发放及水上救助打捞的管理工作；负责全市机动车维修车辆、机动车配件经营市场、机动车综合性能检测站、船舶修造、机动车驾驶员培训、船舶机驾人员培训工作的行业管理。
　　2000年以来，南通交通加快推进跨越式发展，确定了建设枢纽南通的工作目标，枢纽南通的重要标志即建设“三桥、三路、三渡”。“三桥”即苏通大桥、崇启大桥、崇海大桥。“三路”一是“一横一纵一环两联”的高速公路网络；二是“五横六纵一环”的干线公路网络；三是4800公里农村公路网络。“三渡”即通常汽渡的下迁、海太汽渡（太仓方）的上迁、皋张汽渡的新建。为加快推进“三桥、三路、三渡”的建设，南通交通逐年加大交通投入，2000年投入12.8亿元，2001年投入16.7亿元，2002年投入24亿元，2003年投入33亿元，2004年投入41亿元，再创历史新高，是2000年的3.4倍多，是建国以来1949年到1999年50年的总和。截至2004年底，全市拥有公路里程7102公里，其中国道114公里，省道706公里，县道1222公里，乡道5035公里。等级公路占总公路里程的64%。公路密度为88.8公里/百平方公里，等级公路密度为57.3公里/百平方公里。全市拥有航道294条，总里程3515.9公里，其中等级航道33条1214.76公里，等外级航道261条2301.14公里，拥有船闸13座，其中属交通管养船闸5座；套闸13座，可通航节制闸33座。通过近年来对航道进行大规模治理和疏浚整治，目前已形成干支互补，江海河衔接通畅的水运网络体系，可北通盐、淮，西进泰、扬，南航苏、锡、常。内河航道的建设，推动了水上运输业的发展，也有力地促进了南通经济的发展。
　　交通行业管理全力促进运输市场的规范有序。通过实施“线路公司化、车辆新型化”工程，引导客运业户规模化、集约化经营。全面推进道路客运以“公车公营”为标志的运输集约化工程，截至2004年底，全市共有96条班线575辆客车实现了公车公营，省交通厅向全省转发了南通公车公营的经验。推进水路运输“船舶公司化”工程，截至2004年底，全市2263艘船舶有2240艘实现公司化管理，船舶公司化率达到99%。2004年完成拆改挂桨机船舶720艘，进度位列全省第一。截至2004年底，全市共有1649个行政村通达班车，行政村班车通达率达到86.5%。开展汽车维修市场和驾培市场整治，在全省率先推行维修企业客户满意度测评和“诚信驾校”评比活动。开展文明样板路创建活动，204国道创建为部级文明样板路，335省道、336省道、223省道创建为省级文明样板路。着力提高公路管养水平，2004年全市干线公路好路率达到90.2%。强化安全管理，近几年来，交通系统的安全持续保持了平稳的态势，2004年辖区水上安全四项指标为零。
　　交通企事业改革不断增强行业发展的生机和活力。企业改革确立了“三化两率一优”的工作思路，“三化”即实现企业的市场化、精细化、民营化。“两率”即提高股权聚集率和提高国有资本退出率。“一优”即培植优质资产。交通系统共有8家企业国有资本退出，改制为民营企业。全市交通系统生产经营型的事业单位全部完成改制转企，并由事业单位转制为民营企业。行政管理型事业单位的改革以机构人员精简，竞聘上岗，双向选择为重点，顺利实施，圆满完成。
　　交通作风建设努力为交通发展提供有力保障，2000年开展了“讲党性、挑重担、树形象、作贡献”活动，2001年开展了“讲道德、讲表率、讲新风”三项教育活动，2002年开展了“争创人民满意单位、人民满意班组、人民满意岗位”活动，2003年开展了“三学、三查、三创”活动，2004年开展了“三对标、三创优、三提升”活动，通过载体活动的开展，强力推进交通系统作风建设。2001年、2002年连续两年被评为全市目标责任制考核和作风建设先进单位，2003年还被评为全市十佳单位，2004年再次被评为先进单位。2005年，南通市交通局被国家人事部、交通部表彰为全国交通系统先进集体。全力推进南通交通文明行业建设，被省交通厅表彰为全省交通行业文明创建工作先进单位。全系统有1个单位被评为省文明标兵，11个单位被评为省文明单位，总数列全省13个市交通局之首。41个单位被评为市文明单位。全系统有101个服务窗口单位被评为“全市首批文明诚信窗口”，公路处的“您好”工程、地方海事局的“爱心渡、连心桥”工程和运管处的“审批绿色通道”工程被评为全市首批“人民满意服务品牌”。336省道南通收费站被推荐为全国“巾帼示范岗”，如皋收费站被推荐为全国青年文明号。同时还涌现出一大批省、市级青年文明号，汽运集团驾驶员袁秀祥被评为省十佳出租客运（司机）之星。出租车行业涌现了一批先进群体。　　按照党的十六大提出的全面建设小康社会的奋斗目标，南通交通将认真贯彻落实科学发展观，切实加强行政能力建设，坚持以路兴交通的战略、勇争第一方阵的工作主题，把握建设枢纽交通、和谐交通、正气交通、廉政交通、平安交通的工作要求，进一步抢抓机遇，扎实工作，推进南通交通既快又好地发展，为促进南通经济社会的发展做出积极的贡献！